市社保中心设11个内设机构：办公室、组织人事处、社会服务处(信访办公室)、城镇职工保险业务处、城乡居民保险业务处、征收管理处、基金结算处、审计稽核处(法律事务处)、业务数据处理中心、档案资料管理中心、市直业务经办中心，按照有关规定设置纪检监察机构。
市社保中心在17个区县设置分支机构：浦东分中心、闵行分中心、*浦分中心、徐汇分中心、杨浦分中心、奉贤分中心、*浦分中心、静安分中心、虹口分中心、长宁分中心、徐汇分中心、普陀分中心、闸北分中心、宝山分中心、松江分中心、青浦分中心、嘉定分中心、崇明分中心、金山分中心。
各分中心电话及地址见下图：